Job Description P25740 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:26 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 367 % Identity 13% Template d1uqta_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Trehalose-6-phosphate synthase, OtsA Resolution 2.0

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.				.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.					.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																																			.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.																																			.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	A	F	C	L	Y	K	Y	F	P	.	.	.	F	G	G	L	Q	R	D	F	M	R	I	A	S	T	V	A	A	R	G	H	H	V	R	V	Y	T	Q	S	W	E	G	D	C	P	.	.	.	.	K	A	F	E	L	I	Q	V	P	V	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.																																			.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																																			.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	G	A	L	K	A	A	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y	Y	N	Q	F	S	N	A	V	L	W
Template Known Secondary structure																																										S			S	S								T	T																	T	T	T					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
															59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.			80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	N	H	G	R	N	A	E	Y	Y	A	W	V	Q	N	H	L	K	E	H	.	.	P	A	D	R	V	V	G	F	N	K	M	P	G	L	D	V	Y	F	A	A	D	V	C	Y	A	E	K	V	A	Q	E	K	G	F	L	Y	R	L	T	S	R	Y	R	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P	F	P	T	P	E	I	F	N	A
Template Known Secondary structure					T	T		G	G	G																							G	G	G			T	T							S	G	G	G	T	T								T	T			S								S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	A	F	E	R	A	T	F	E	Q	G	K	S	T	K	L	M	M	L	T	D	K	Q	I	A	D	F	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	Q	T	E	P	E	R	F	Q	I	L	P	P	G	I	Y	P	D	R	K	Y	S	E	Q	I	P	N	S	R	E	I	Y	R
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A
Template Known Secondary structure		S	T	T									T	T	S	S					S	S															S						T	T	T					T	T																							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.					.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	K	N	G	I	K	E	Q	Q	N	L	L	L	Q	V	G	S	D	F	G	R	K	G	V	D	R	S	I	E	A	L	A	S	L	P	E	S	L	R	H	.	.	.	.	N	T	L	L	F	V	V	G	Q	D	K	P	R	K	F	E	A	L	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G
Template Known Secondary structure							T	T	T										B		G	G	G																	G	G	G	T	T	T									B		S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
				248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.						.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure		.	.																																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	K	L	G	V	R	S	N	V	H	F	F	S	G	R	N	D	V	S	E	L	M	A	A	A	D	L	L	L	H	P	A	Y	Q	E	A	A	G	I	V	L	L	E	A	I	T	A	G	L	P	.	.	.	.	.	V	L	T	T	A	V	C	G	Y	A	H	Y	I	A	D	A	N	C	G	T	V	I	A	E
Query Conservation		.	.																																																		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																																		.	.	.	.	.																.	.	.					.
Template Conservation																																																																									.	.	.					.
Template Sequence		Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	F	A	G	A	A	N	E	L	T	S	.	.	.	A	L	I	V	.	N
Template Known Secondary structure		B	T	T	B		S						S															S							S	S	B	S												S		T	T	S								T	T	B	G	G	G	G	T		T	T	.	.	.	S				.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.					.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.				.	.	.	400		.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																		.
Query SS confidence																		.
Query Sequence		P	F	S	Q	E	Q	L	N	E	V	L	R	K	A	L	T	.	Q	S	P	L	R	M	A	W	A	E	N	A	R	H	Y	A	D	T	Q	D	L	Y	S	L	P	E	K	A	A	D	I	I	T	G	G	L
Query Conservation																		.
Alig confidence																		.
Template Conservation
Template Sequence		P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K	Q	I	V
Template Known Secondary structure		T	T														T																				T																S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.