Job Description P25740 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:26 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 372 % Identity 16% Template c2r60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl transferase, group 1; PDBTitle: structure of apo sucrose phosphate synthase (sps) of2 halothermothrix orenii Resolution 1.80 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.													.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.														.	.	50	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	I	V	A	F	C	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Y	F	P	F	G	G	L	Q	R	D	F	M	R	I	A	S	T	V	A	A	R	G	H	H	V	R	V	Y	T	Q	S	W	E	G	D	C	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	E	L	I	Q	V	P
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	H	V	A	F	L	N	P	Q	G	N	F	D	P	A	D	S	Y	W	T	E	H	P	D	F	G	G	Q	L	V	Y	V	K	E	V	S	L	A	L	A	E	M	G	V	Q	V	D	I	I	T	R	R	I	K	D	E	N	W	P	E	F	S	G	E	I	D	Y	Y	Q	E	T	N	K	V	R	I	V	R	I	P
Template Known Secondary structure										S	S				T	T		T	T	T	T	S	B	T	T	B	S																T	T												B	T	T	B	G	G	G			S					T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.							.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80			.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.															.	.																																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.															.	.																																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	K	S	H	T	N	H	G	R	N	A	.	.	.	.	.	.	E	Y	Y	A	W	V	Q	N	H	L	K	E	H	P	.	.	A	D	R	V	V	G	F	N	K	M	P	G	L	D	V	Y	F	A	A	D	V	C	Y	A	E	K	V	A	Q	E	K	G	F	L	Y	R	L	T	S	R	Y	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.															.	.																																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.															.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	G	D	K	F	L	P	K	E	E	L	W	P	Y	L	H	E	Y	V	N	K	I	I	N	F	Y	R	E	E	G	K	F	P	Q	V	V	T	T	H	Y	G	D	G	G	L	A	G	V	L	L	K	N	I	K	G	L	P	F	T	F	T	G	H	S	L	G	A	Q	K	M	E	K	L	N	V	N	T	S	N
Template Known Secondary structure			S		S	S				G	G	G		G	G	G																T				S																													S	S								T	T				S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
										122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.								.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	R	H	Y	A	A	F	E	R	A	T	F	E	Q	G	K	S	T	K	L	M	M	L	T	D	K	Q	I	A	D	F	Q	K	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	E	P	E	R	F	Q	I	L	P	P	G	I	Y	P	D	R	K	Y	S	E	Q	I	P	N	S	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	K	E	M	D	E	R	F	K	F	H	R	R	I	I	A	E	R	L	T	M	S	Y	A	D	K	I	I	V	S	T	S	Q	E	R	F	G	Q	Y	S	H	D	L	Y	R	G	A	V	N	V	E	D	D	D	K	F	S	V	I	P	P	G	V	N	T	R	V	F	D	G	E	Y	G	D	K	I	K	A	K	I
Template Known Secondary structure		S																								S					S	S							T	T	T	S	G	G	G	T	T	T			T	T		G	G	G								B		T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
			183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	R	E	I	Y	R	Q	K	N	G	I	K	E	Q	Q	N	L	L	L	Q	V	G	S	D	F	G	R	K	G	V	D	R	S	I	E	A	L	A	S	L	P	E	S	L	R	H	N	T	L	L	F	V	V	G	Q	D	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	F	E	A	L
Query Conservation		.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	K	Y	L	E	R	D	L	G	S	E	R	M	E	L	P	A	I	I	A	S	S	R	L	D	Q	K	K	N	H	Y	G	L	V	E	A	Y	V	Q	N	K	E	L	Q	D	K	A	N	L	V	L	T	L	R	G	I	E	N	P	F	E	D	Y	S	R	A	G	Q	E	E	K	E	I	L	G	K	I	I	E	L
Template Known Secondary structure									S		G	G	G	T	T	S							S				G	G	G											T															S	S		S	B	T	T	T	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.							.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	K	L	G	V	R	S	N	V	H	F	F	S	G	R	N	D	.	.	.	.	.	.	V	S	E	L	M	A	A	A	D	L	L	L	H	P	A	Y	Q	E	A	A	G	I	V	L	L	E	A	I	T	A	G	L	P	V	L	T	T	A	V	C	G	Y	A	H	Y	I	A	D	A	N	C	G	T	V	I	A
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		I	D	N	N	D	C	R	G	K	V	S	M	F	P	L	N	S	Q	Q	E	L	A	G	C	Y	A	Y	L	A	S	K	G	S	V	F	A	L	T	S	F	Y	E	P	F	G	L	A	P	V	E	A	M	A	S	G	L	P	A	V	V	T	R	N	G	G	P	A	E	I	L	D	G	G	K	Y	G	V	L	V	.
Template Known Secondary structure					T	T		B	T	T								S														T	T								S		B				S								T	T							S	S	B						T	G	G	G	T	S	S				.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.		.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		E	P	F	S	Q	E	Q	L	N	E	V	L	R	K	A	L	T	Q	S	P	L	R	M	A	W	A	E	N	A	R	H	Y	A	.	D	T	Q	D	L	Y	S	L	P	E	K	A	A	D	I	I	T	G	G	L	D
Query Conservation																																			.
Alig confidence																																			.
Template Conservation
Template Sequence		D	P	E	D	P	E	D	I	A	R	G	L	L	K	A	F	E	S	E	E	T	W	S	A	Y	Q	E	K	G	K	Q	R	V	E	E	R	Y	T	W	Q	E	T	A	R	G	Y	L	E	V	I	Q	E	I	A	D
Template Known Secondary structure			T	T														S																				S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.