Job Description P31447 Confidence 99.27% Date Thu Jan 5 11:47:37 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 279 % Identity 18% Template c3a52A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cold-active alkaline phosphatase; PDBTitle: crystal structure of cold-active alkailne phosphatase from2 psychrophile shewanella sp. Resolution 2.20 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.								.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.				.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query Sequence		N	F	L	F	V	M	T	D	T	Q	A	T	N	M	V	G	C	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	G	K	P	L	N	T	Q	N	I	D	S	L	A	A	E	G	I	R	F	N	S	A	Y	.	.	.	T	C	S	P	V	C	T	P	A	R	A	G	L	F	T	G	I	Y	A	N	Q	S	G	P	W	T	N	N
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.														.										.	.	.																									.	.
Template Conservation																																									.																																					.	.
Template Sequence		G	M	I	I	M	V	G	D	G	M	G	P	A	Y	T	S	A	Y	R	Y	F	Q	D	N	P	D	T	E	E	I	E	Q	T	V	F	D	R	L	L	.	V	G	M	A	S	T	Y	P	A	R	E	S	G	Y	V	T	D	S	A	A	S	A	T	A	L	A	T	G	F	K	S	Y	N	G	A	I	.	.	A	V
Template Known Secondary structure									T	T																T	T	S	S	S											.										G	G	G		S														S					T	T		B	.	.	S	B
Template Predicted Secondary structure																																									.																																					.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.			.	.
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120																																		.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	P	G	K	N	I	S	T	M	G	R	Y	F	K	D	A	G	Y	H	T	C	Y	I	G	K	W	H	L	D	G	H	D	Y	F	G	T	G	E	C	P	P	E	W	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	N	K	R	P	L	T	T	I	M	Q	M	A	K	A	R	G	M	S	T	G	V	A	V	T	A	Q	V	N	H	A	T	P	A	A	F	L	T	H	N	E	S	R	K	N	Y	E	A	I	A	A	D	M	L	K	S	D	A	D	V	I	L	G	G	G	R	K	Y	F	S	E	A	L	V	S	Q	F	S	A
Template Known Secondary structure			T	T			B											T	T											T	T	S										B	S		T	T													T		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	F	D	G	A	N	Y	L	S	E	L	T	E	K	E	I	S	L	W	R	N	G	L	N	S	V	E	D	L	Q	A	N	H	I	D	E	T	F	T	W	A	H	R	I	S	N	R	A	V	D	F	L	Q	Q	P	A	R	A	D	E	P	F	L	M	V	V	S	Y	D	E	P	H	H	P	F	T	C	P	V
Query Conservation
Alig confidence																				.																																					.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.																																					.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	Y	Q	H	I	T	E	L	A	Q	L	D	S	I	T	Q	P	.	K	V	L	G	L	F	A	E	V	Q	L	P	W	V	I	D	D	T	D	A	N	T	L	S	K	L	T	Q	K	S	L	D	L	L	S	Q	.	.	.	N	E	K	G	F	V	L	L	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T						S	G	G	G	G	G	G			S	S	.							S	S	S	S				G	G	G	S	S		S															T	T	.	.	.		T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.																																					.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.				.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	L	E	K	Y	A	D	F	Y	Y	E	L	G	E	K	A	Q	D	D	L	A	N	K	P	E	H	H	R	L	W	A	Q	A	M	P	S	P	V	G	D	D	G	L	Y	H	H	P	L	Y	F	A	C	N	D	F	V	D	D	Q	I	G	R	V	I	N	A	L	T	P	E	Q	R	E	N	T	W	V	I	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	L	I	D	W	A	G	H	N	N	D	I	A	T	A	M	A	E	M	Q	G	F	A	N	A	I	E	V	V	E	Q	Y	I	R	Q	H	P	.	.	D	T	L	L	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T								T	T																												.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template SS confidence
																																				223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260			.	.	.	.	.	.
		282	.	.	.				.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	S	D	H	.	.	.	G	E	M	M	G	A	H	K	L	I	S	K	G	A	A	M	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	D	H	N	T	G	G	L	S	I	G	A	N	G	E	Y	Q	W	D	T	K	L	P	K	G	I	S	A	S	P	A	S	I	A	T	H	A	I	A	A	D	D	W	Q	A	G	V	N	Q	Q	L	G	F	D	V	N	S	T	E	L	Q	Q	L	T	N	A	R	M	Q	G	K	S	T	L	E	V	A	L	K
Template Known Secondary structure				S				T	T				S	B	T	T	B										T			S													S	S										T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
																	303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	I	T	R	I	P	L	I	I	R	S	P	Q	G	E	R	R	Q	V	D	T	P	V	S	H	I	D	L	L	P	T	M	M	A	L	A	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		K	I	I	D	T	R	S	Y	T	G	W	T	T	S	G	H	T	G	V	D	V	Q	V	F	A	M	G	P	A	.	.	A	D	L	F	K	G	N	Q	D	N	T	H	I	A	E	K	M	M	S	L	L	P
Template Known Secondary structure									T				S		S	S												S	T	T	.	.	G	G	G	G																T	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.