Job Description P31447 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:37 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 356 % Identity 17% Template c2w8dB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:processed glycerol phosphate lipoteichoic acid synthase 2; PDBTitle: distinct and essential morphogenic functions for wall- and2 lipo-teichoic acids in bacillus subtilis Resolution 2.35 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.			.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.												.
Query SS confidence																																						.	.												.
Query Sequence		K	R	P	N	F	L	F	V	M	T	D	T	Q	A	T	N	M	V	G	C	Y	S	G	K	P	L	N	T	Q	N	I	D	S	L	A	A	.	.	E	G	I	R	F	N	S	A	Y	T	C	.	S	P	V	C	T	P	A	R	A	G	L	F	T	G	I	Y	A	N	Q	S	G	P	W	T	N	N	V	A	P	G
Query Conservation																																						.	.												.
Alig confidence																																						.	.												.																													.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		E	G	K	N	V	I	Y	V	S	L	E	S	L	Q	S	F	I	I	D	Y	K	I	D	G	K	E	V	T	P	F	L	N	K	L	A	H	D	N	E	T	F	Y	F	D	N	F	F	H	Q	T	G	Q	G	K	S	D	A	E	F	X	X	E	N	S	L	Y	P	L	A	Q	G	S	V	F	V	N	K	A	.	Q
Template Known Secondary structure		T	T									T	T			G	G	G	T	T				T	T			S	S									S	S	S	S				S	S							T	T																S	S	S							T	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320		.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	I	S	T	M	G	R	Y	F	K	D	A	G	Y	H	T	C	Y	I	G	K	W	H	L	D	G	H	D	Y	F	G	T	G	E	C	P	P	E	W	D	A	D	Y	W	F	D	G	A	N	Y	L	S	E	L	T	E	K	E	I	S	L	W	R	N	G	L	N	S	V	E	D	L	Q	A	N	H	I	D	E
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	L	Q	S	V	P	A	I	L	K	S	K	N	Y	T	S	A	T	F	H	G	N	T	Q	T	.	.	.	F	W	N	R	N	E	X	Y	K	A	E	G	I	D	K	F	F	D	S	A	Y	Y	D	X	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	T	K	N
Template Known Secondary structure		S									G	G	G	G	T								S	S		T	T	.	.	.	G	G	G									T							G	G	G	S				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B		S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.				.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	F	T	W	A	H	R	I	S	N	R	A	V	D	F	L	Q	Q	P	A	R	A	D	E	P	F	L	M	V	V	S	Y	D	E	P	H	H	P	F	T	C	P	V	E	Y	L	E	K	Y	A	D	F	Y	Y	E	L	G	E	K	A	Q	D	D	L	A	N	K	P	E	H	H	R	L	W	A	Q	A	M	P	S
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	X	K	D	K	P	F	F	K	E	S	X	P	L	L	E	.	.	.	S	L	P	Q	P	F	Y	T	K	F	I	T	L	S	N	H	F	P	F	G	X	D	E	G	D	T	D	F	P	A	G	D	F	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	B															.	.	.	T	S		S	S									S	S		T	T					B	T	T	B							S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.				.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.		.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.									.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	G	D	D	G	L	Y	H	H	P	L	Y	F	A	C	N	D	F	V	D	D	Q	I	G	R	V	I	N	A	L	T	P	E	Q	.	R	E	N	T	W	V	I	Y	T	S	D	H	G	E	M	M	G	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	I	S	K	G	A	A	M	Y	D	D	I	T	R	I	P
Query Conservation																																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																													.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	S	V	V	D	N	Y	F	Q	S	A	H	Y	L	D	Q	S	I	E	Q	F	F	N	D	L	K	K	D	G	L	Y	D	K	S	I	I	V	X	Y	G	D	H	Y	G	I	S	E	N	H	N	K	A	X	A	K	V	L	G	K	D	E	I	T	D	Y	D	N	A	Q	L	Q	R	V	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																											T	S		G	G	G									S		S	S		G	G	G								T	T	S	S										T	T	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.		.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		L	I	I	R	S	P	Q	G	E	R	R	Q	V	D	T	P	V	S	H	I	D	L	L	P	T	M	M	A	L	A	D	I	E	K	P	E	I	L	.	P	G	E	N	I	L	A	V	K	E	P	R	G	V	M	V	E	F	N	R	Y	E	I	E	H	D	S	F	G	G	F	I	P	V	R	C	W	V	T	D	D
Query Conservation																																								.
Alig confidence																																								.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	I	H	A	A	G	V	K	G	E	K	V	H	K	Y	A	G	D	V	D	V	A	P	T	I	L	H	L	L	G	V	D	T	K	D	Y	L	X	S	G	S	D	I	L	S	K	E	H	R	E	V	I	P	F	R	N	G	D	F	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	Y	T	K	I	S	G	K
Template Known Secondary structure							T	T	S							S				G	G	G									T	T				T	T	S							T	T	S	T	T								T	T	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S					T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.										.	.	.	570	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.		.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		F	K	L	V	L	N	L	F	T	.	S	D	E	L	Y	D	R	R	N	D	P	N	E	M	H	N	L	I	D	D	I	R	F	A	D	V	R	S	K	M
Query Conservation											.
Alig confidence											.																				.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		Y	Y	D	T	K	T	G	K	E	L	D	E	S	E	V	D	K	S	E	D	S	L	V	K	K	E	L	E	X	.	.	S	D	K	I	I	N	G	D	L
Template Known Secondary structure					T	T	T			B			T	T	T	S		T													.	.								T	G
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.			.	.	.	.	.	610	.	.	.