Job Description P31447 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:37 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 357 % Identity 16% Template c2w5tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:processed glycerol phosphate lipoteichoic acid PDBTitle: structure-based mechanism of lipoteichoic acid synthesis by2 staphylococcus aureus ltas. Resolution 1.60 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.				40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.																			.	.
Query SS confidence																																								.	.	.																			.	.
Query Sequence		K	R	P	N	F	L	F	V	M	T	D	T	Q	A	T	N	M	V	G	C	Y	S	G	K	P	L	N	T	Q	N	I	D	S	L	A	A	E	G	.	.	.	I	R	F	N	S	A	Y	T	C	S	P	V	C	T	P	A	R	A	.	.	G	L	F	T	G	I	Y	A	N	Q	S	G	P	W	T	N	N	V	A
Query Conservation																																								.	.	.																			.	.
Alig confidence																																								.	.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	K	K	N	I	I	K	I	H	L	E	S	F	Q	T	F	L	I	N	K	K	V	N	G	K	E	V	T	P	F	L	N	K	L	S	S	G	K	E	Q	F	T	Y	F	P	N	F	F	H	Q	T	G	Q	G	K	T	S	D	S	E	F	T	M	D	N	S	L	Y	G	L	P	Q	G	S	A	F	S	L	K	G
Template Known Secondary structure		T	T									T	T			G	G	G	T	T				T	T			S	S								T	T		S	S					T	T							T	T	T											S					S	S	S						S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	K	N	I	S	T	M	G	R	Y	F	K	D	A	G	Y	H	T	C	Y	I	G	K	W	H	L	D	G	H	D	Y	F	G	T	G	E	C	P	P	E	W	D	A	D	Y	W	F	D	G	A	N	Y	L	S	E	L	T	E	K	E	I	S	L	W	R	N	G	L	N	S	V	E	D	L	Q	A	N	H	I
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	N	T	Y	Q	S	L	P	A	I	L	D	Q	K	Q	G	Y	K	S	D	V	M	H	G	D	Y	K	T	.	.	.	F	W	N	R	D	Q	V	Y	K	H	F	G	I	D	K	F	Y	D	A	T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	M	S	D	K	N	V
Template Known Secondary structure		T	S																						S	S		T	T	.	.	.	G	G	G									T							G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.				.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	380	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	T	F	T	W	A	H	R	I	S	N	R	A	V	D	F	L	Q	Q	P	A	R	A	D	E	P	F	L	M	V	V	S	Y	D	E	P	H	H	P	F	T	C	P	V	E	Y	L	E	K	Y	A	D	F	Y	Y	E	L	G	E	K	A	Q	D	D	L	A	N	K	P	E	H	H	R	L	W	A	Q	A	M
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	N	L	G	L	K	D	K	I	F	F	K	D	S	A	N	Y	Q	A	K	.	.	.	M	K	S	P	F	Y	S	H	L	I	T	L	T	N	H	Y	P	F	T	L	D	E	K	D	A	T	I	E	K	S	N	T	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T																	T	.	.	.	S		S	S									S	S		T	T					G	G	G			S					S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.				.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.		.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.								.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	S	P	V	G	D	D	G	L	Y	H	H	P	L	Y	F	A	C	N	D	F	V	D	D	Q	I	G	R	V	I	N	A	L	T	P	E	Q	.	R	E	N	T	W	V	I	Y	T	S	D	H	G	E	M	M	G	A	H	K	.	.	.	.	.	.	.	L	I	S	K	G	A	A	M	Y	D	D	I	T	R	I
Query Conservation																																							.																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	V	D	G	Y	I	Q	T	A	R	Y	L	D	E	A	L	E	E	Y	I	N	D	L	K	K	K	G	L	Y	D	N	S	V	I	M	I	Y	G	D	H	Y	G	I	S	E	N	H	N	N	A	M	E	K	L	L	G	E	K	I	T	P	A	K	F	T	D	L	N	R	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												T		S	T	T	S								S		S	S		G	G	G									T	S										T	T	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.		.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.
Query SS confidence																																									.
Query Sequence		P	L	I	I	R	S	P	Q	G	E	R	R	Q	V	D	T	P	V	S	H	I	D	L	L	P	T	M	M	A	L	A	D	I	E	K	P	E	I	L	.	P	G	E	N	I	L	A	V	K	E	P	R	G	V	M	V	E	F	N	R	Y	E	I	E	H	D	S	F	G	G	F	I	P	V	R	C	W	V	T	D
Query Conservation																																									.
Alig confidence																																									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	W	I	K	I	P	G	K	S	G	G	I	N	N	E	Y	A	G	Q	V	D	V	M	P	T	I	L	H	L	A	G	I	D	T	K	N	Y	L	M	F	G	T	D	L	F	S	K	G	H	N	Q	V	V	P	F	R	N	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	T	K
Template Known Secondary structure								T	T												G	G	G										T				T	T	S			S				T	T	S	T	T								T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	570
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	K	L	V	L	N	L	F	T	S	D	E	L	Y	D	R	R	N	D	P	N	E	M	H	N	L	I	D	D	I	R	F	A	D	V	R	S	K	M	H	D	A	L	L	D	Y	M	D	K
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	K	Y	V	.	.	.	.	.	N	G	K	I	Y	S	N	K	N	N	E	L	I	T	T	Q	P	A	D	F	E	K	N	K	K	Q	V	E	K	D	L	E	M	S	D	N	V	L	N	G
Template Known Secondary structure		S					.	.	.	.	.	T	T					T	T	T			B			S			T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		571	.	.	.	.						.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.