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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1u1qa_ | Ferredoxin-like | RNA-binding domain, RBD | Canonical RBD |
Added to library: Tue Mar 16 14:23:20 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | E | P | E | Q | L | R | K | L | F | I | G | G | L | S | F | E | T | T | D | E | S | L | R | S | H | F | E | Q | W | G | T | L | T | D | C | V | V | M | R | D | P | N | T | K | R | S | R | G | F | G | F | V | T | Y | A | T | V | E | E | V | D | A | A | M | N | A | R | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | S | T | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | V | D | G | R | V | V | E | P | K | R | A | V | S | R | E | D | S | Q | R | P | G | A | H | L | T | V | K | K | I | F | V | G | G | I | K | E | D | T | E | E | H | H | L | R | D | Y | F | E | Q | Y | G | K | I | E | V | I | E | I | M | T | D | R | G | S | G | K | K | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | ||||
Sequence | F | A | F | V | T | F | D | D | H | D | S | V | D | K | I | V | I | Q | K | Y | H | T | V | N | G | H | N | C | E | V | R | K | A | L | S | K | Q | E | M | A | S | A | S | |||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | T | T | T |
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