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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8jj5D_ | 3.50 | PDB header: membrane protein | Chain: D: PDB Molecule: upk1b; |
Added to library: Sat Jun 17 13:22:33 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | V | R | C | F | Q | S | L | L | V | F | G | N | V | I | I | G | M | C | G | I | A | L | T | A | E | C | I | F | F | V | S | D | Q | Y | S | L | Y | P | L | L | E | A | T | D | N | D | D | I | Y | G | A | A | W | I | G | I | F | V | G | I | C | L | F | C | L | S | V | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | V | G | I | M | K | S | N | R | K | I | L | L | V | Y | F | I | L | M | F | I | V | Y | G | F | E | V | A | S | C | I | T | A | A | T | Q | R | D | F | F | T | P | N | L | F | L | K | Q | M | L | E | R | Y | Q | N | N | S | P | P | S | N | D | D | K | W | K | N | N | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | K | T | W | D | R | L | M | L | Q | D | Y | C | C | G | V | N | G | P | S | D | W | Q | K | Y | T | S | A | F | R | T | E | N | N | D | A | D | Y | P | W | P | R | Q | C | C | V | M | N | K | L | K | E | P | L | N | L | E | A | C | K | L | G | V | P | G | Y | Y | H | N | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | S | S | T | T | T | S | S | G | G | G | B | B | T | T | S | S | B | S | T | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . |
Sequence | G | C | Y | E | L | I | S | G | P | M | N | R | H | A | W | G | V | A | W | F | G | F | A | I | L | C | W | T | F | W | V | L | L | G | T | M | F | Y | W | S | R | I | E | Y | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T |
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