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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8iomA_ | 3.00 | PDB header: antimicrobial protein | Chain: A: PDB Molecule: colicin 1b; |
Added to library: Sat Apr 8 13:28:47 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | Q | K | I | A | E | E | K | R | K | R | D | E | I | N | M | V | K | D | A | I | K | L | T | S | D | F | Y | R | T | I | Y | D | E | F | G | K | Q | A | S | E | L | A | K | E | L | A | S | V | S | Q | G | K | Q | I | K | S | V | D | D | A | L | N | A | F | D | K | F | R | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | L | N | K | K | Y | N | I | Q | D | R | M | A | I | S | K | A | L | E | A | I | N | Q | V | H | M | A | E | N | F | K | L | F | S | K | A | F | G | F | T | G | K | V | I | D | R | Y | D | V | A | V | E | L | Q | K | A | V | K | T | D | N | W | R | P | F | F | V | K | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | |||||||
Sequence | S | L | A | A | G | R | A | A | S | A | V | T | A | W | A | F | S | V | M | L | G | T | P | V | G | I | L | G | F | A | I | I | M | A | A | V | S | A | L | V | N | D | K | F | I | E | Q | V | N | K | L | I | G | I | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | B | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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