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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8fisL_ | 3.18 | PDB header: viral protein | Chain: L: PDB Molecule: j3-vrc26.25 light; |
Added to library: Sat Feb 4 20:12:03 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | Q | L | V | E | S | G | G | G | L | V | Q | A | G | G | F | L | E | L | S | C | E | L | R | G | S | I | F | N | Q | Y | A | M | A | W | F | R | Q | A | P | G | K | E | R | E | F | V | A | G | M | G | A | V | P | H | Y | G | E | F | V | K | G | R | F | T | I | S | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | A | K | S | T | V | Y | L | Q | M | S | S | L | E | P | E | D | T | A | I | Y | F | C | A | R | S | K | S | T | Y | I | S | Y | N | S | N | G | Y | D | Y | W | G | Q | G | T | Q | V | T | V | S | S | G | G | S | G | G | G | G | S | G | G | G | G | S | G | G | Q | S | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | B | T | T | B | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | Q | P | P | S | V | S | A | A | P | G | Q | K | V | T | I | S | C | S | G | N | T | S | N | I | G | N | N | F | V | S | W | Y | Q | Q | R | P | G | R | A | P | Q | L | L | I | Y | E | T | D | K | R | P | S | G | I | P | D | R | F | S | A | S | K | S | G | T | S | G | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | S | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | A | I | T | G | L | Q | T | G | D | E | A | D | Y | Y | C | A | T | W | A | A | S | L | S | S | A | R | V | F | G | T | G | T | Q | V | I | V | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T |
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