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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8fedG_ | 2.76 | PDB header: membrane protein | Chain: G: PDB Molecule: abc transporter, atp-binding protein,green fluorescent |
Added to library: Sat Feb 25 10:14:49 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | V | Q | I | D | V | T | G | L | S | K | S | F | G | S | S | K | I | W | E | D | V | T | M | S | I | P | A | G | E | V | S | V | L | L | G | P | S | G | T | G | K | S | V | F | L | K | S | L | I | G | L | L | R | P | E | R | G | S | I | V | I | D | G | T | D | I | L | Q | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | A | K | E | L | Y | E | I | R | T | L | F | G | V | L | F | Q | D | G | A | L | F | G | S | M | N | I | Y | D | N | T | A | F | P | L | R | E | H | T | K | K | S | E | S | E | I | R | K | I | V | M | E | K | L | D | L | V | G | M | P | N | D | G | H | K | F | P | G | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | G | G | M | R | K | R | A | G | L | A | R | A | L | V | L | D | P | E | I | I | L | C | D | E | P | D | S | G | L | D | P | V | R | T | A | Y | L | S | Q | L | L | I | D | I | N | A | Q | I | D | A | T | V | L | I | V | T | H | N | I | N | I | A | R | T | V | P | D | N | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | M | L | F | R | K | Q | L | V | M | F | G | P | R | E | V | L | L | T | S | E | E | P | V | V | K | Q | F | L | N | G | R | R | I | G | P | I | G | M | S | E | E | K | D | V | P | P | Q | L | Q | A | T | P | G | M | P | E | R | K | A | V | A | R | R | K | A | R | V | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | L | H | T | L | P | P | A | A | Q | A | A | I | L | E | E | L | D | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T |
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