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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8e9gB_ | 2.60 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: nadh-quinone oxidoreductase subunit b; |
Added to library: Sat Oct 15 12:29:13 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | E | E | R | L | P | G | G | I | L | L | S | T | V | E | T | V | A | G | Y | V | R | K | G | S | L | W | P | A | T | F | G | L | A | C | C | A | I | E | M | M | S | T | A | G | P | R | F | D | I | A | R | F | G | M | E | R | F | S | A | T | P | R | Q | A | D | L | M | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | T | T | B | B | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | T | B | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | A | G | R | V | S | Q | K | M | A | P | V | L | R | Q | I | Y | D | Q | M | V | E | P | K | W | V | L | A | M | G | V | C | A | S | S | G | G | M | F | N | N | Y | A | V | V | Q | G | V | D | H | V | V | P | V | D | I | Y | L | P | G | C | P | P | R | P | E | M | L | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | B | S | S | G | G | G | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | ||
Sequence | A | I | L | K | L | H | D | K | I | Q | Q | M | P | L | G | V | N | R | E | E | A | I | R | E | A | E | Q | A | A | L | A | V | P | P | T | I | E | L | K | G | L | L | R | |||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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