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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8d8lO_ | 2.60 | PDB header: ribosome | Chain: O: PDB Molecule: 37s ribosomal protein s28, mitochondrial; |
Added to library: Sat Dec 17 08:58:59 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | A | K | A | V | K | F | L | K | A | Q | R | R | K | Q | K | N | E | A | K | Q | A | T | L | K | A | S | T | D | K | V | D | P | V | L | G | R | A | D | T | P | F | I | T | R | I | M | A | E | L | K | E | P | L | V | L | S | K | G | Y | N | I | E | E | V | D | K | F | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | B | S | T | T | T | S | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | E | S | A | K | R | E | R | I | E | K | L | E | D | R | R | E | A | I | L | R | I | L | S | M | R | N | S | E | N | K | N | A | I | K | M | A | V | E | L | A | R | K | E | F | E | R | F | P | G | D | T | G | S | S | E | V | Q | A | A | C | M | T | V | R | I | Q | N | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | N | H | I | K | E | H | R | K | D | F | A | N | T | R | N | L | R | I | L | V | Q | Q | R | Q | A | I | L | R | Y | L | K | R | D | N | P | E | K | Y | Y | W | T | I | Q | K | L | G | L | N | D | A | A | I | T | D | E | F | N | M | D | R | R | Y | M | Q | D | Y | E | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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