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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8c7jA_ | 2.00 | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: fab heavy chain with knob domain; |
Added to library: Sat Jun 10 08:54:19 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | Q | L | V | E | S | G | G | G | L | V | K | P | G | G | S | L | R | L | S | C | A | A | S | G | Y | T | F | T | D | N | Y | I | H | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | I | G | Y | I | N | P | S | S | A | Y | A | H | Y | N | E | K | F | K | T | R | F | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | V | D | K | A | G | T | C | P | D | G | Y | T | R | T | N | Y | Y | C | R | R | D | G | C | G | S | W | C | N | G | A | E | R | Q | Q | P | C | I | R | G | P | C | C | C | D | L | T | Y | R | T | G | K | N | S | A | Y | L | Q | M | N | S | L | R | A | E | D | T | A | V | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | C | T | R | R | Y | Y | S | A | M | P | F | A | Y | W | G | Q | G | T | L | V | T | V | S | S | A | S | T | K | G | P | S | V | F | P | L | A | P | S | S | K | S | T | S | G | G | T | A | A | L | G | C | L | V | K | D | Y | F | P | E | P | V | T | V | S | W | N | S | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | B | T | T | T | T | S | B | S | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | L | T | S | G | V | H | T | F | P | A | V | L | Q | S | S | G | L | Y | S | L | S | S | V | V | T | V | P | S | S | S | L | G | T | Q | T | Y | I | C | N | V | N | H | K | P | S | N | T | K | V | D | K | K | V | E | P | K | S | C | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | T | S | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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