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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8bfhA_ | 2.20 | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: ccr4-not transcription complex subunit 11; |
Added to library: Sat Dec 31 10:47:34 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | R | I | A | K | A | F | K | S | P | L | S | S | P | Q | Q | T | Q | L | L | G | E | L | E | K | D | P | K | L | V | Y | H | I | G | L | T | P | A | K | L | P | D | L | V | E | N | N | P | L | V | A | I | E | M | L | L | K | L | Q | S | S | Q | I | T | E | Y | F | S | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | G | G | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | N | D | S | L | H | S | E | V | V | N | R | L | T | T | A | V | D | L | P | P | E | F | I | H | L | Y | I | S | N | C | I | S | T | C | E | Q | I | K | D | K | Y | Q | N | R | L | V | R | L | V | C | V | F | L | Q | S | L | I | R | N | K | I | I | N | V | Q | D | L | F | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | V | Q | A | F | C | I | E | F | S | R | I | R | E | A | A | G | L | F | R | L | L | K | T | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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