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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8b6lH_ | 7.60 | PDB header: membrane protein | Chain: H: PDB Molecule: translocon-associated protein subunit delta; |
Added to library: Sat Dec 10 08:55:34 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | C | L | E | P | Q | I | T | P | S | Y | Y | T | T | S | D | A | V | I | S | T | E | T | V | F | I | V | E | I | S | L | T | C | K | N | R | V | Q | N | M | A | L | Y | A | D | V | G | G | K | Q | F | P | V | T | R | G | Q | D | V | G | R | Y | Q | V | S | W | S | L | D | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | S | A | H | A | G | T | Y | E | V | R | F | F | D | E | E | S | Y | S | L | L | R | K | A | Q | R | N | N | E | D | I | S | I | I | P | P | L | F | T | V | S | V | D | H | R | G | T | T | E | V | L | A | A | A | I | G | L | V | I | Y | Y | L | A | F | S | A | K | S | H | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | G | G | G | S | S |   | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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