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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8b4oB_ | 2.00 | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: cytochrome bd-type quinol oxidase subunit ii; |
Added to library: Sat Dec 31 10:54:08 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | D | H | N | T | F | W | F | I | L | I | A | F | L | F | S | G | Y | F | L | L | E | G | F | D | F | G | V | G | I | L | A | P | I | I | G | K | D | S | A | A | R | N | T | V | I | R | T | I | G | P | V | W | D | G | N | E | V | W | L | I | V | A | G | G | A | L | F | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | P | E | W | Y | A | T | M | F | S | G | M | Y | L | P | L | F | L | V | L | V | S | L | I | I | R | V | V | G | L | E | W | R | K | K | V | D | D | P | R | W | Q | K | W | S | D | R | A | I | F | I | G | S | W | T | P | P | L | M | W | G | F | I | F | A | N | I | L | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | P | I | K | A | D | H | T | I | D | A | A | A | A | L | P | G | M | V | N | V | F | A | I | L | G | A | L | A | F | T | A | L | F | A | L | H | G | L | A | F | I | R | L | K | T | A | G | R | V | R | T | D | A | A | K | A | A | P | G | V | A | L | L | A | A | V | T | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | T | T | S | B | S | S | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | F | V | L | W | A | A | I | A | Y | G | R | S | W | S | W | I | L | A | V | L | I | I | A | A | V | L | G | G | A | F | A | L | I | K | D | R | D | G | L | S | F | L | S | T | S | V | A | V | I | G | V | V | A | L | L | F | S | S | L | F | P | N | V | M | P | T | T | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | |||||||
Sequence | D | G | V | S | L | D | I | W | N | A | S | A | S | H | Y | A | L | T | I | L | T | W | T | A | A | V | I | A | P | L | V | V | L | Y | Q | G | W | T | Y | W | V | F | R | K | R | L | H | A | E | P | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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