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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8axfC_ | 2.54 | PDB header: viral protein | Chain: C: PDB Molecule: nucleocapsid protein; |
Added to library: Sat Apr 8 13:27:02 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | D | L | K | P | I | D | V | E | V | Q | A | F | T | S | A | S | Q | N | I | S | N | F | T | L | H | K | Y | R | N | I | C | H | V | D | T | C | A | A | H | L | S | K | S | K | E | N | K | E | K | L | Q | A | R | N | L | R | L | I | V | S | S | N | E | F | L | V | V | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | L | N | D | S | T | V | D | N | V | V | S | F | N | K | A | C | A | I | M | S | A | G | V | L | K | H | T | F | D | E | E | F | D | W | K | L | S | K | Y | V | K | T | N | N | T | T | K | V | I | P | D | V | K | I | I | N | R | L | A | G | Q | M | G | L | S | A | G | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | Y | W | M | I | V | P | G | Y | E | F | L | Y | E | L | Y | P | A | E | V | L | A | Y | T | L | V | R | L | Q | Y | R | K | N | L | N | I | P | D | S | M | T | D | A | D | I | V | S | S | L | V | M | K | M | N | R | I | H | K | L | E | Q | T | S | F | D | E | A | L | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | T | T | G | G | G | G | G | G | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . |
Sequence | I | G | K | D | N | V | S | E | A | Y | V | E | L | A | R | D | I | G | S | T | S | K | T | K | R | N | D | E | A | I | L | K | F | R | E | L | I | A | S | F | L | P | A | L | E | A | D | R | I | A | S | A | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S |
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