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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8alzA_ | 3.40 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: activating signal cointegrator 1; |
Added to library: Sat Mar 11 09:47:24 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | H | P | C | D | C | L | G | Q | K | H | K | L | I | N | N | C | L | I | C | G | R | I | V | C | E | Q | E | G | S | G | P | C | L | F | C | G | T | L | V | C | T | H | E | E | Q | D | I | L | Q | R | D | P | L | G | V | L | V | N | P | N | M | Y | Q | S | P | P | Q | W | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | T | T | T | B | T | T | S | S | S | B | T | T | T | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | H | T | G | A | A | S | Q | K | K | A | F | R | S | S | G | F | G | L | E | F | N | S | F | Q | H | Q | L | R | I | Q | D | Q | E | F | Q | E | G | F | D | G | G | W | C | L | S | V | H | Q | P | W | A | S | L | L | V | R | G | I | K | R | V | E | G | R | S | W | Y | T | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | R | G | R | L | W | I | A | A | T | A | K | K | P | S | P | Q | E | V | S | E | L | Q | A | T | Y | R | L | L | R | G | K | D | V | E | F | P | N | D | Y | P | S | G | C | L | L | G | C | V | D | L | I | D | C | L | S | Q | K | Q | F | K | E | Q | F | P | D | I | S | Q | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | B | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||
Sequence | S | D | S | P | F | V | F | I | C | K | N | P | Q | E | M | V | V | K | F | P | I | K | G | N | P | K | I | W | K | L | D | S | K | I | H | Q | G | A | K | K | G | L | M | K | Q | N | K | A | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S |
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