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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8afoA_ | 1.99 | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: neural cell adhesion molecule l1; |
Added to library: Sat Mar 11 10:25:50 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | T | A | A | P | E | K | N | P | V | D | V | K | G | E | G | N | E | T | T | N | M | V | I | T | W | K | P | L | R | W | M | D | W | N | A | P | Q | V | Q | Y | R | V | Q | W | R | P | Q | G | T | R | G | P | W | Q | E | Q | I | V | S | D | P | F | L | V | V | S | N | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | F | V | P | Y | E | I | K | V | Q | A | V | N | S | Q | G | K | G | P | E | P | Q | V | T | I | G | Y | S | G | E | D | Y | P | Q | A | I | P | E | L | E | G | I | E | I | L | N | S | S | A | V | L | V | K | W | R | P | V | D | L | A | Q | V | K | G | H | L | R | G | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | T | Y | W | R | E | G | S | I | H | K | D | H | V | V | V | P | A | N | T | T | S | V | I | L | S | G | L | R | P | Y | S | S | Y | H | L | E | V | Q | A | F | N | G | R | G | S | G | P | A | S | E | F | T | F | S | T | P | E | G | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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