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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8a7rB_ | 2.00 | PDB header: biosynthetic protein | Chain: B: PDB Molecule: isoprenyl diphosphate synthase; |
Added to library: Sat Jun 3 16:45:31 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | S | K | E | E | S | R | E | F | M | A | I | F | P | D | I | V | R | D | L | T | D | A | G | R | H | T | D | I | P | E | V | T | K | R | F | A | K | V | L | Q | Y | N | V | P | T | G | K | K | T | R | G | L | S | T | V | I | A | Y | K | M | L | E | K | P | E | N | L | T | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | N | V | R | L | A | G | I | L | G | W | C | V | E | L | L | Q | A | S | L | L | I | M | D | D | L | M | D | F | L | A | I | N | D | C | L | H | V | E | S | S | L | Y | S | V | L | R | K | Y | F | S | H | L | P | C | Y | V | P | I | I | E | L | F | H | D | V | N | F | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | M | G | Q | S | L | D | A | L | C | M | K | D | G | R | P | I | L | S | Q | F | T | M | K | R | Y | S | S | I | V | K | Y | K | T | S | Y | Y | T | F | Q | L | P | V | S | L | G | M | Y | L | A | D | M | Y | D | P | E | Q | H | R | Q | A | K | T | I | L | M | E | I | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | F | Q | I | Q | D | D | F | L | D | A | F | G | D | V | G | T | D | I | K | E | G | K | C | S | W | L | A | V | V | A | L | Q | R | S | N | P | A | Q | R | Q | I | M | E | E | H | Y | G | R | P | E | P | E | S | T | Q | I | I | K | N | L | Y | I | E | L | G | L | P | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | F | A | V | Y | E | E | E | S | F | N | I | I | R | T | H | I | H | Q | I | S | K | G | L | P | H | D | L | F | F | K | A | M | K | K | I | Y | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
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