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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8a01C_ | 3.20 | PDB header: virus | Chain: C: PDB Molecule: major capsid protein p5; |
Added to library: Sat Dec 17 09:09:37 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | I | A | T | I | T | G | V | T | K | S | P | E | L | Q | V | T | K | A | I | G | A | L | I | L | S | S | D | V | A | L | S | A | L | T | T | E | K | I | S | I | Y | I | E | R | G | N | G | S | N | V | I | L | A | N | K | V | L | L | K | D | F | I | L | A | S | T | Y | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | E | N | T | Q | S | D | A | D | N | A | M | I | A | L | C | E | L | A | D | E | G | S | I | Y | L | A | D | K | E | S | I | K | I | T | L | E | D | L | I | S | D | K | R | Y | D | L | H | G | I | E | E | P | Q | Q | T | N | N | L | F | F | F | E | Q | K | S | V | A | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | B | S | S | S | B | S | S | S | B | S | S | S | T | T | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | F | N | K | K | I | D | V | Q | G | F | D | L | A | I | M | T | V | D | D | S | V | S | D | L | S | Y | Q | Y | S | N | G | Q | V | V | K | Y | L | P | F | E | L | Q | T | L | S | R | D | I | D | P | I | Q | A | V | L | S | D | G | K | V | V | Q | G | L | T | D | R | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | L | P | L | V | A | V | V | G | I | E | I | N | K | S | Q | G | S | I | I | N | F | V | V | R | C | L | K | T | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
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