| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c7zxnA_ | 3.06 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: gap junction beta-1 protein; |
Added to library: Sat Jun 3 16:39:33 2023 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | N | W | T | G | L | Y | T | L | L | S | G | V | N | R | H | S | T | A | I | G | R | V | W | L | S | V | I | F | I | F | R | I | M | V | L | V | V | A | A | E | S | V | W | G | D | E | K | S | S | F | I | C | N | T | L | Q | P | G | C | N | S | V | C | Y | D | Q | F | F | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | S | H | V | R | L | W | S | L | Q | L | I | L | V | S | T | P | A | L | L | V | A | M | H | V | A | H | Q | Q | H | I | E | K | K | M | L | R | L | R | H | K | V | H | I | S | G | T | L | W | W | T | Y | V | I | S | V | V | F | R | L | L | F | E | A | V | F | M | Y | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | |
Sequence | Y | L | L | Y | P | G | Y | A | M | V | R | L | V | K | C | D | V | Y | P | C | P | N | T | V | D | C | F | V | S | R | P | T | E | K | T | V | F | T | V | F | M | L | A | A | S | G | I | C | I | I | L | N | V | A | E | V | V | Y | L | I | I | R | A | C | A | R | R | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|