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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7yleA_ | 2.05 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: glycine betaine/proline abc transporter, periplasmic |
Added to library: Sat Jan 28 08:58:15 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | C | G | E | V | S | I | T | E | M | N | W | A | S | A | S | V | V | T | T | V | A | T | F | L | M | E | Q | G | Y | G | C | A | V | T | V | V | P | S | S | T | V | P | A | V | T | S | V | S | E | T | G | E | P | D | I | L | T | E | L | W | L | S | S | L | P | N | Y | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | E | A | Q | G | T | V | R | T | L | T | E | V | L | S | D | G | G | Q | E | G | W | W | V | P | Q | Y | L | A | E | A | H | P | E | V | T | T | I | E | G | I | L | A | N | P | D | L | V | G | G | R | F | H | R | S | P | D | G | W | A | A | A | I | V | D | S | S | L | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | G | G | G | G | B | G | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | W | D | L | E | G | N | G | I | E | V | F | A | H | G | S | G | E | T | L | A | T | S | I | A | A | A | Y | A | D | R | E | P | W | F | G | Y | Y | W | A | P | T | S | V | L | G | K | F | P | M | V | M | V | D | L | G | E | F | D | A | D | I | H | A | C | N | S | K | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | T | S | S | T | T | S | S | B | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | A | N | V | G | K | S | P | Y | P | R | A | R | V | I | T | A | V | T | P | G | F | A | E | E | N | P | E | I | I | E | M | L | S | N | L | S | F | T | N | D | Q | M | G | A | I | L | A | W | Q | E | E | N | G | A | S | S | E | E | A | A | V | W | F | L | S | N | N | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | W | A | G | W | V | N | D | A | A | R | E | N | L | A | A | L | I | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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