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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7x77A_ | 2.20 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: per os infectivity factor 5; |
Added to library: Sat Jun 25 08:58:33 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | W | P | G | V | P | M | S | F | F | S | N | L | R | A | V | N | K | L | Y | P | N | Q | A | S | F | I | T | D | N | T | R | L | L | T | S | T | P | A | G | F | T | N | V | L | N | A | P | S | V | R | N | I | G | N | N | R | F | Q | P | G | Y | Q | L | S | N | N | Q | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T | G | G | G | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | T | S | D | I | N | R | I | T | R | N | N | D | V | P | N | I | R | G | V | F | Q | G | I | S | D | P | Q | I | N | S | L | S | Q | L | R | R | V | D | N | V | P | D | F | N | Y | H | T | K | Q | T | R | S | N | A | V | K | Q | N | F | P | E | T | N | V | R | T | P | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | Q | N | A | L | Q | Q | N | P | R | L | H | S | Y | M | Q | S | L | K | V | G | G | T | G | I | L | L | A | T | G | G | Y | F | L | F | S | A | A | T | L | V | Q | D | I | I | N | A | I | N | N | T | G | G | S | Y | Y | V | Q | G | K | D | A | G | E | I | A | E | A | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | L | Q | R | T | C | R | Q | D | P | V | T | I | C | P | F | D | P | L | L | P | N | N | P | P | E | L | T | N | M | C | Q | G | F | N | Y | E | V | E | K | T | V | C | R | G | S | D | P | S | A | D | P | D | S | P | Q | Y | V | D | I | S | D | L | P | A | G | Q | T | L | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | B | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | B | T | T | S | T | T | S | T | T | B | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | C | I | E | P | Y | S | F | G | D | L | V | G | D | L | G | L | D | W | L | L | G | D | E | G | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | T | T | T |
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