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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7w40A_ | 3.00 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: maltodextrin-binding protein,gastrin-releasing peptide |
Added to library: Sat Feb 25 10:34:24 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | G | I | L | Y | V | I | P | A | V | Y | G | V | I | I | L | I | G | L | I | G | N | I | T | L | I | K | I | F | C | T | V | K | S | M | R | N | V | P | N | L | F | I | S | S | L | A | L | G | D | L | L | L | L | I | T | C | A | P | V | D | A | S | R | Y | L | A | D | R | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | F | G | R | I | G | C | K | L | I | P | F | I | Q | L | T | S | V | G | V | S | V | F | T | L | T | A | L | S | A | D | R | Y | K | A | I | V | R | P | M | D | I | Q | A | S | H | A | L | M | K | A | C | L | K | A | A | F | I | W | I | I | S | M | L | L | A | I | P | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | F | S | D | L | H | P | F | H | E | E | S | T | N | Q | T | F | I | S | C | A | P | Y | P | H | S | N | E | L | H | P | K | I | H | S | M | A | S | F | L | V | F | Y | V | I | P | L | S | I | I | S | V | Y | Y | Y | F | I | A | K | N | L | I | Q | S | A | Y | N | L | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | G | N | I | H | V | K | K | Q | I | E | S | R | K | R | L | A | K | T | V | L | V | F | V | G | L | F | A | F | C | W | L | P | N | H | V | I | Y | L | Y | R | S | Y | H | Y | S | E | V | D | T | S | M | L | H | F | V | T | S | I | C | A | R | L | L | A | F | T | N | S | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | N | P | F | A | L | Y | L | L | S | K | S | F | R | K | Q | F | N | T | Q | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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