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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7vmyA_ | 1.77 | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: lynf/truf/patf family peptide o-prenyltransferase; |
Added to library: Sat Aug 6 08:46:15 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | F | K | S | T | I | A | P | E | E | K | L | R | Y | I | G | N | H | K | Q | A | F | D | I | E | P | L | Y | P | L | A | L | F | E | E | F | V | A | T | T | G | D | C | I | I | E | C | S | G | K | I | K | Q | D | Q | L | Y | P | A | R | I | D | L | Q | F | S | D | K | H | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | H | N | I | H | T | S | I | D | F | L | K | R | A | A | S | R | T | D | V | N | L | N | L | D | I | L | A | T | F | L | A | G | N | F | D | Y | S | K | V | Q | N | I | L | A | G | I | D | L | R | Q | N | L | G | E | S | K | L | K | L | F | I | R | I | G | D | Y | P | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | T | T | T | G | G | G | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | A | V | A | K | H | L | C | N | I | T | P | E | S | E | A | M | L | R | S | D | T | L | H | I | G | F | D | F | Y | L | D | G | R | S | A | I | E | L | Y | P | E | L | K | K | D | E | F | N | H | P | F | I | Y | N | Q | L | K | T | I | L | S | P | E | A | L | K | P | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | B | S | T | S | S | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | C | N | L | F | G | I | G | L | S | P | A | N | E | A | N | V | L | Y | Y | H | L | E | N | I | E | D | F | L | S | Y | F | P | I | N | D | T | A | R | R | V | H | D | F | Y | L | Q | Q | E | G | S | R | R | M | W | V | A | L | S | E | S | E | M | K | A | G | R | I | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | B | T | T | S | S | S | G | G | G | B | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | N | L | Y | Y | S | K | A | F | T | S | Q | N | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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