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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7vlxZ_ | 3.12 | PDB header: membrane protein | Chain: Z: PDB Molecule: pts mannose family transporter subunit iid; |
Added to library: Sat Dec 4 08:40:53 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | L | S | K | R | D | R | L | R | V | A | W | R | S | T | F | I | Q | G | S | W | N | Y | E | R | M | Q | N | G | G | W | A | F | S | M | I | P | A | I | K | K | L | Y | K | T | K | E | D | R | S | S | A | L | K | R | H | L | E | F | F | N | T | H | P | Y | I | A | S | P | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | V | T | L | A | L | E | E | E | R | A | N | G | A | E | V | D | D | V | A | I | Q | G | V | K | V | G | M | M | G | P | L | A | G | V | G | D | P | V | F | W | F | T | I | R | P | M | L | G | A | L | G | A | S | L | A | L | S | G | N | I | L | G | P | I | L | F | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | W | N | V | I | R | W | G | F | M | W | Y | T | Q | E | F | G | Y | K | A | G | S | K | I | T | D | D | L | S | G | G | L | L | Q | D | I | T | K | G | A | S | I | L | G | M | F | V | L | A | A | L | V | Q | R | W | V | N | I | Q | F | A | P | I | I | S | K | V | K | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | G | A | Y | I | D | W | S | H | L | P | Q | G | A | Q | G | I | K | T | A | L | Q | Q | Q | Q | A | G | L | A | L | S | E | I | K | V | T | T | L | Q | N | N | L | D | N | L | I | P | G | L | A | A | V | A | L | T | F | L | C | M | W | L | L | K | K | K | I | S | P | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | T | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | I | L | G | L | F | V | V | G | I | V | G | H | L | I | G | L | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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