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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7vemA_ | 2.39 | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: the nadph-assisted quinone oxidoreductase; |
Added to library: Sat Nov 13 09:40:31 2021 | |
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Sequence | A | T | N | T | V | Y | R | I | N | D | R | T | S | H | H | N | L | V | R | L | N | E | P | L | P | S | V | H | G | H | E | V | L | V | E | I | R | G | V | T | L | N | A | R | D | I | Q | I | C | G | G | F | Y | P | A | A | A | V | K | D | N | L | V | P | C | S | D | G | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | I | A | A | V | G | D | A | V | N | D | L | E | I | G | D | R | V | I | I | N | I | S | F | D | N | L | Y | G | P | L | K | S | Q | K | Y | M | L | G | G | G | V | D | G | T | L | R | Q | Y | A | A | V | P | A | H | A | I | I | K | V | P | V | D | C | K | L | D | Y | V | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | B | B | T | T | T | B | S | B | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | S | L | V | C | T | G | A | T | V | W | N | A | L | Y | G | Y | V | P | M | K | P | G | Q | T | V | L | F | Q | G | T | G | G | V | S | I | T | G | V | Q | L | A | K | A | A | G | A | V | T | I | V | T | S | S | S | D | E | K | L | E | F | V | K | D | K | F | G | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | V | I | N | Y | K | T | T | P | N | W | A | E | E | V | R | R | F | T | N | G | E | G | A | D | Y | V | I | E | I | G | G | A | G | T | I | E | Q | S | I | Q | A | T | A | S | G | G | M | I | A | V | I | G | Y | L | A | D | I | K | Q | E | N | M | P | N | V | P | L | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | L | I | Q | G | C | A | L | R | G | V | Q | A | G | S | K | Q | L | T | T | E | M | V | N | F | V | S | R | K | N | V | Q | P | Y | I | H | K | T | F | G | F | T | E | N | E | V | M | A | A | F | D | L | Q | N | S | G | K | Q | I | G | K | V | G | I | A | V | K | D | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | S | S | S |
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