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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7vboA_ | 1.50 | PDB header: sugar binding protein | Chain: A: PDB Molecule: alginate lyase; |
Added to library: Sat Sep 10 09:54:11 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | L | A | P | T | D | D | T | Y | V | E | N | K | S | S | T | V | D | S | N | F | A | T | S | K | Q | L | K | F | K | G | T | S | K | G | S | D | D | R | I | G | Y | L | K | F | D | I | S | N | F | K | G | E | I | D | K | A | Y | I | E | L | E | G | K | T | S | S | S | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | B | S | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Y | P | P | I | D | I | S | I | H | G | L | T | D | D | T | W | S | E | T | D | L | T | W | N | N | S | P | N | H | E | P | G | S | A | K | V | V | G | L | G | E | T | A | T | F | L | G | K | V | T | V | N | F | G | E | Y | H | K | V | E | L | D | I | T | D | Y | I | K | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | B | S | S | B | T | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | |||
Sequence | H | S | D | N | K | D | G | I | V | A | L | X | I | S | D | Q | D | Q | N | N | A | Y | G | W | F | R | S | T | Q | E | T | S | E | D | T | Y | P | K | L | I | L | V | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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