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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7upnF_ | 3.50 | PDB header: isomerase/viral protein | Chain: F: PDB Molecule: virion infectivity factor; |
Added to library: Sat Jan 28 09:02:40 2023 | |
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Sequence | E | I | G | P | Q | L | P | L | W | A | W | K | E | T | A | F | S | I | N | Q | E | P | Y | W | Y | S | T | I | R | L | Q | G | L | M | W | N | K | R | G | H | K | L | M | F | V | K | E | N | Q | G | Y | E | Y | W | E | T | S | G | K | Q | W | K | M | E | I | R | R | D | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | I | R | N | A | W | Q | Y | K | S | Q | G | E | W | K | T | I | G | V | W | Y | E | S | P | G | D | Y | K | G | K | E | N | Q | F | W | F | H | W | R | I | A | L | C | S | C | N | K | T | R | W | D | I | R | E | F | M | I | G | K | H | R | W | D | L | C | K | S | C | I | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | G | E | I | V | K | N | T | N | P | R | S | L | Q | R | L | A | L | L | H | L | A | K | D | H | V | F | Q | V | M | P | L | W | R | A | R | R | V | T | V | Q | K | F | P | W | C | R | S | P | M | G | Y | T | I | P | W | S | L | Q | E | C | W | E | M | E | S | I | F | E | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S |
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