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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7um4A_ | 2.80 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: 5-hydroxytryptamine receptor 5a; |
Added to library: Sat Jul 23 09:43:31 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | L | S | V | F | G | V | L | I | L | T | L | L | G | F | L | V | A | A | T | F | A | W | N | L | L | V | L | A | T | I | L | P | H | N | L | V | A | S | M | A | V | S | N | V | L | V | A | A | L | V | M | P | L | S | L | V | H | E | L | S | G | R | R | W | Q | L | G | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | C | Q | L | W | I | A | C | D | V | L | C | C | T | A | S | I | W | N | V | T | A | I | A | L | D | R | Y | W | S | I | T | R | H | M | E | Y | T | L | R | T | R | K | C | V | S | N | V | M | I | A | L | T | W | A | L | S | A | V | I | S | L | A | P | L | L | F | G | W | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | T | Y | S | E | G | S | E | E | C | Q | V | S | R | E | P | S | Y | A | V | F | S | T | V | G | A | F | Y | L | P | L | C | V | V | L | F | V | Y | W | K | I | Y | K | A | A | K | F | R | V | E | Q | K | E | Q | R | A | A | L | M | V | G | I | L | I | G | V | F | V | L | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | W | A | P | F | F | L | T | E | L | I | S | P | L | C | S | C | D | I | P | A | I | W | K | S | I | F | L | W | L | G | Y | S | N | S | F | F | N | P | L | I | Y | T | A | F | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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