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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7t7iH_ | 3.97 | PDB header: viral protein | Chain: H: PDB Molecule: nuclear egress protein 1; |
Added to library: Sat Jul 9 08:39:13 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | R | S | H | F | S | L | R | D | F | F | R | G | I | S | A | N | F | E | L | G | K | D | F | L | R | E | M | N | T | P | I | H | V | S | E | A | V | F | L | P | L | S | L | C | T | L | S | P | G | R | C | L | R | L | S | P | F | G | H | S | L | T | L | G | S | H | C | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | I | N | R | S | Q | V | H | V | P | Q | E | F | S | S | T | Q | L | S | F | F | N | N | V | H | K | I | I | P | N | K | T | F | Y | V | S | L | L | S | S | S | P | S | A | V | K | A | G | L | S | Q | P | S | L | L | Y | A | Y | L | V | T | G | H | F | C | G | T | I | C | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | F | S | T | N | G | K | G | R | L | I | M | H | L | L | L | Q | G | T | S | L | H | I | P | E | T | C | L | K | L | L | C | E | N | I | G | P | T | Y | E | L | A | V | D | L | V | G | D | A | F | C | I | K | V | S | P | R | D | T | V | Y | E | K | A | V | N | V | D | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | I | Y | E | A | I | K | D | L | E | C | G | D | E | L | R | L | Q | I | I | N | Y | T | Q | L | I | L | E | N | K | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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