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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7s6gA_ | 2.02 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: phosphonate abc type transporter/ substrate binding |
Added to library: Sat Oct 30 08:44:59 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | M | Q | P | R | L | K | V | G | A | I | P | D | Q | N | P | E | R | L | N | R | L | Y | G | Q | L | A | D | E | L | S | D | R | L | N | V | K | V | R | Y | V | P | V | S | N | Y | P | A | A | V | S | A | F | R | T | G | G | L | D | L | V | W | F | G | G | L | T | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | A | R | L | Q | T | P | G | A | Q | V | L | A | Q | R | D | I | D | A | R | F | R | S | V | F | I | A | N | T | S | S | G | L | Q | P | I | S | S | I | N | G | L | T | S | L | R | G | K | R | F | S | F | G | S | E | S | S | T | S | G | R | L | M | P | Q | H | F | L | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | G | G | B | T | T | S | S | S | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | V | T | P | S | Q | F | S | G | G | R | A | G | F | S | G | S | H | D | A | T | I | A | V | V | Q | S | G | A | Y | E | A | G | A | L | N | E | Q | V | W | T | S | A | V | N | D | G | R | V | N | T | E | K | V | S | V | I | W | R | T | P | E | Y | V | D | Y | H | W | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | S | T | S | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . |
Sequence | V | R | P | K | L | D | Q | R | F | G | K | G | F | T | T | R | L | Q | K | A | I | L | G | L | E | P | T | T | P | R | Q | V | T | I | L | E | L | F | A | A | K | R | F | I | P | V | E | A | S | Q | Y | K | P | I | E | K | V | G | R | E | L | G | K | I | R | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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