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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7rwzA_ | 4.00 | PDB header: virus | Chain: A: PDB Molecule: cos capsid morphogenesis protein (ccm); |
Added to library: Sat Nov 20 08:29:58 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | N | I | Q | E | L | P | T | A | R | K | E | V | F | K | E | L | L | V | N | R | E | L | P | Q | T | L | R | D | V | I | T | I | T | D | D | E | H | V | E | S | I | P | A | L | S | Y | I | K | D | K | L | A | T | N | G | I | E | L | S | L | N | G | S | S | K | Y | F | D | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | G | G | G | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | E | G | H | I | Y | T | E | V | A | D | S | V | V | H | G | S | D | R | T | L | D | D | L | L | K | E | I | F | I | N | E | C | V | S | Y | E | T | T | L | L | L | D | K | N | N | A | S | G | L | I | D | K | D | N | Q | D | L | S | L | Y | N | Q | G | I | K | E | V | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | S | M | Y | D | G | I | K | Q | A | M | K | D | I | P | Q | T | F | R | R | K | V | S | V | V | M | N | T | E | H | H | D | K | L | I | K | E | L | A | Q | M | G | L | G | T | L | A | G | D | L | T | K | L | F | N | V | S | H | V | V | V | T | D | D | A | Q | D | I | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 |
Sequence | G | D | F | G | H | A | I | Y | A | K | Y | E | P | I | M | Y | N | K | K | K | Q | A | L | K | G | V | Y | Q | F | A | L | N | Y | V | F | D | I | K | I | V | P | E | L | L | R | I | V | K | V | K | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | S | B | B | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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