| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c7qpcA_ | 3.44 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: auxin efflux carrier component 8; |
Added to library: Sat Jul 9 08:54:25 2022 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | G | I | S | W | L | D | I | Y | H | V | V | S | A | T | V | P | L | Y | V | S | M | T | L | G | F | L | S | A | R | H | L | K | L | F | S | P | E | Q | C | A | G | I | N | K | F | V | A | K | F | S | I | P | L | L | S | F | Q | I | I | S | E | N | N | P | F | K | M | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | I | L | S | D | I | L | Q | K | F | L | V | V | V | V | L | A | M | V | L | R | F | W | H | P | T | G | G | R | G | G | K | L | G | W | V | I | T | G | L | S | I | S | V | L | P | N | T | L | I | L | G | M | P | I | L | S | A | I | Y | G | D | E | A | A | S | I | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | I | V | V | L | Q | S | L | I | W | Y | T | I | L | L | F | L | F | E | L | N | A | A | R | A | G | T | M | K | I | L | L | K | A | W | R | K | L | I | I | N | P | N | T | Y | A | T | L | I | G | I | I | W | A | T | L | H | F | R | L | G | W | N | L | P | E | M | I | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | I | H | L | L | S | D | G | G | L | G | M | A | M | F | S | L | G | L | F | M | A | S | Q | S | S | I | I | A | C | G | T | K | M | A | I | I | T | M | L | L | K | F | V | L | G | P | A | L | M | I | A | S | A | Y | C | I | R | L | K | S | T | L | F | K | V | A | I | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | A | A | L | P | Q | G | V | V | P | F | V | F | A | K | E | Y | N | L | H | P | E | I | I | S | T | G | V | I | F | G | M | L | I | A | L | P | T | T | L | A | Y | Y | F | L | L | D | L | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | S | T | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|