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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7pv2L_ | 3.20 | PDB header: viral protein | Chain: L: PDB Molecule: head-tail connector (portal protein); |
Added to library: Sat Oct 15 12:33:01 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | K | T | I | G | E | I | Q | R | R | R | G | N | L | W | F | R | T | Y | Q | R | Y | L | F | S | L | A | Y | Q | M | F | E | W | Q | G | L | P | K | T | V | D | P | I | F | L | E | K | Q | L | H | Q | R | G | F | V | A | F | Y | K | D | E | M | Y | G | Y | L | G | V | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | L | S | G | Q | I | N | L | Y | N | Q | P | N | F | Y | T | A | S | A | P | T | Y | Q | K | S | F | P | L | Y | W | Y | D | M | G | E | D | L | N | E | K | G | Q | G | I | V | I | Y | N | N | L | E | R | M | P | T | L | D | I | L | N | L | Y | A | M | N | L | A | E | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | S | B | S | S | B | S | S | S | S | S | B | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | T | I | Y | V | N | Q | N | A | Q | K | T | P | V | I | I | K | A | G | D | N | D | L | F | S | M | K | Q | V | Y | N | K | Y | E | G | N | E | P | V | I | F | A | G | K | K | F | N | T | D | D | I | E | V | L | K | T | D | A | P | Y | V | A | D | K | L | T | M | L | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | Q | W | N | E | A | M | T | F | L | G | L | S | Q | I | Q | G | S | A | N | I | Y | L | A | P | R | Q | E | A | C | R | L | I | N | E | Y | Y | G | L | N | V | S | V | K | L | R | K | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
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