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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7p20A_ | 1.40 | PDB header: allergen | Chain: A: PDB Molecule: pathogenesis-related 5 protein jun a 3.0101; |
Added to library: Sat Jul 16 08:47:30 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | V | K | F | D | I | K | N | Q | C | G | Y | T | V | W | A | A | G | L | P | G | G | G | K | R | L | D | Q | G | Q | T | W | T | V | N | L | A | A | G | T | A | S | A | R | F | W | G | R | T | G | C | T | F | D | A | S | G | K | G | S | C | Q | T | G | D | C | G | G | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | S | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | C | T | V | S | G | A | V | P | A | T | L | A | E | Y | T | Q | S | D | Q | D | Y | Y | D | V | S | L | V | D | G | F | N | I | P | L | A | I | Q | P | T | N | A | Q | C | T | A | P | A | C | K | A | D | I | N | A | V | C | P | S | E | L | K | V | D | G | G | C | N | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | B | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | C | N | V | F | K | T | D | Q | Y | C | C | R | N | A | Y | V | D | N | C | P | A | T | Q | Y | S | K | I | F | K | N | Q | C | P | Q | A | Y | S | Y | A | K | D | D | T | A | T | F | A | C | A | S | G | T | D | Y | S | I | V | F | C | P | H | H | H | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T | T | S | B | S | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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