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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7p0lB_ | 1.97 | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: dna damage response protein mdb1; |
Added to library: Sat Dec 4 08:34:45 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | N | L | V | T | S | S | F | N | L | T | K | P | M | K | S | F | I | R | R | N | G | L | R | V | Q | E | S | V | T | D | E | T | D | F | V | I | L | G | S | P | P | L | R | R | T | H | K | F | L | L | A | T | S | L | G | I | P | L | V | S | S | Q | Y | L | T | D | C | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | K | V | L | D | F | R | S | Y | K | Y | K | D | E | E | A | E | A | K | W | G | F | R | L | D | D | I | H | R | R | T | C | F | N | G | K | R | L | Y | I | T | K | A | I | R | D | S | M | V | G | D | S | I | H | G | L | Y | S | I | L | E | T | S | G | A | E | I | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | B | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . |
Sequence | D | I | K | R | A | Q | E | K | D | T | I | I | L | A | Q | P | D | N | D | Q | E | G | R | N | M | S | A | T | G | L | N | V | Y | K | I | E | L | V | A | L | S | I | L | R | D | R | I | D | F | D | E | F | L | I | D | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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