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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7ogpB_ | 3.30 | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: phikz068; |
Added to library: Sat Jul 10 08:32:55 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | K | T | K | Q | R | V | T | P | G | D | I | V | A | Y | N | L | D | A | L | D | V | V | K | L | V | H | K | I | D | D | T | V | P | V | E | L | I | Q | E | C | L | D | C | V | A | V | T | A | T | K | D | I | Y | P | H | Q | I | L | L | A | Q | W | V | M | H | K | A | F | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | T | G | G | G | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | R | A | F | S | H | I | N | K | N | A | V | N | H | L | L | A | A | A | Q | S | L | M | W | H | W | G | F | Q | Q | V | A | V | F | M | Q | V | E | L | Y | R | I | Q | I | K | Y | K | D | V | M | D | E | L | Y | P | H | Q | R | Q | Q | R | A | I | N | G | V | P | V | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | V | N | I | A | G | I | A | V | Q | S | A | H | A | S | I | R | S | S | N | W | I | Y | H | G | P | D | R | L | F | K | E | A | E | Q | V | T | Q | N | K | V | L | V | V | P | A | T | I | K | S | V | I | T | E | L | V | I | H | L | G | K | L | N | Q | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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