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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7nkyZ_ | 3.20 | PDB header: transcription | Chain: Z: PDB Molecule: transcription elongation factor spt5; |
Added to library: Sat Jul 10 08:33:55 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | T | I | W | G | V | R | C | R | P | G | K | E | K | E | L | I | R | K | L | L | K | K | K | F | N | L | D | R | A | M | G | K | K | K | L | K | I | L | S | I | F | Q | R | D | N | Y | T | G | R | I | Y | I | E | A | P | K | Q | S | V | I | E | K | F | C | N | G | V | P | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | Y | I | S | Q | K | L | L | I | P | V | Q | E | L | P | L | L | L | K | P | N | L | S | E | V | A | L | G | K | T | V | R | I | R | S | A | G | Y | K | G | Q | L | G | I | V | K | D | V | N | G | D | K | A | T | V | E | L | H | S | K | N | K | H | I | T | I | D | K | H | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | T | Y | Y | N | R | E | G | G | E | G | I | T | Y | D | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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