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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7ndeA_ | 1.45 | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: glucuronan lyase; |
Added to library: Sat Mar 5 09:03:03 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | F | L | D | P | S | C | A | P | G | G | N | F | D | L | S | V | W | S | L | Q | L | P | T | G | S | A | G | K | V | D | T | I | K | S | R | D | L | Q | G | C | N | G | Y | T | G | P | T | F | F | T | D | K | S | N | G | E | L | I | L | T | A | P | G | N | P | D | I | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | B | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | A | T | T | S | G | S | E | H | C | R | T | E | L | R | E | V | D | S | A | T | G | Q | N | T | D | W | A | P | A | G | T | N | T | L | T | V | A | M | K | V | I | Q | A | D | D | G | S | H | G | T | A | I | G | Q | V | F | A | A | A | A | S | K | P | L | A | E | M | Y | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | T | B | B | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | Q | K | G | D | I | T | V | G | V | K | Q | G | P | S | G | N | Q | A | I | T | K | L | G | T | V | P | L | G | T | Y | F | T | Y | I | M | S | Y | S | D | D | V | L | S | I | S | I | N | G | N | K | T | T | L | D | T | F | S | W | G | T | P | N | C | Y | F | K | S | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | N | Q | G | K | T | A | V | T | S | E | V | H | I | Q | S | I | A | V | V | H | D | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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