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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7mcsA_ | 3.56 | PDB header: dna binding protein/dna | Chain: A: PDB Molecule: transposon tn7 transposition protein tnsc; |
Added to library: Sat Feb 26 08:30:52 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | R | I | Q | A | V | Y | R | D | T | G | V | E | A | Y | R | D | N | P | F | I | E | A | L | P | P | L | Q | T | H | L | L | L | S | E | R | I | S | V | M | I | R | G | G | Y | V | G | R | N | P | K | T | G | D | L | Q | K | H | L | Q | N | G | Y | E | R | V | Q | T | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | E | T | F | R | F | E | E | A | R | S | T | A | Q | S | L | L | L | I | G | C | S | G | S | G | K | T | T | S | L | H | R | I | L | A | T | Y | P | Q | V | I | Y | H | R | E | L | N | V | E | Q | V | V | Y | L | K | I | D | C | S | H | N | G | S | L | K | E | I | C | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S | S | B | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | F | R | A | L | D | R | A | L | G | S | N | Y | E | R | R | Y | G | L | K | R | H | G | I | E | T | M | L | A | L | M | S | Q | I | A | N | A | H | V | L | G | L | L | V | I | D | E | I | Q | H | L | S | R | S | R | S | G | G | S | Q | E | M | L | N | F | F | V | T | M | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | B | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||
Sequence | N | I | I | G | V | P | V | M | L | I | G | T | P | K | A | R | E | I | F | E | A | D | L | R | S | A | R | R | G | A | G | F | G | A | I | F | W | D | P | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | G | T | T | T | S | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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