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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7kmxd_ | 3.20 | PDB header: virus | Chain: D: PDB Molecule: major capsid protein; |
Added to library: Sat Nov 13 08:26:56 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | A | F | N | N | A | V | L | Q | E | V | S | D | L | P | A | G | E | V | I | K | A | S | P | H | N | V | S | A | F | E | V | F | Q | N | G | L | I | E | G | R | F | V | K | F | D | A | G | S | I | D | I | L | D | A | S | A | T | P | T | I | A | G | I | A | K | R | K | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | E | I | G | P | G | V | Y | S | T | S | G | I | E | I | D | Q | V | A | E | V | I | N | F | G | F | A | T | V | T | V | Q | D | A | A | A | P | S | K | Y | D | P | V | Y | A | I | N | L | D | S | A | E | A | G | K | A | T | E | N | S | G | A | T | G | A | L | A | V | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | B | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | |||||||||||||||||||
Sequence | C | V | F | W | E | Q | K | A | A | N | V | W | L | V | R | M | N | K | F | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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