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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7f6lB_ | 3.20 | PDB header: dna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: probable crossover junction endonuclease eme2; |
Added to library: Sat Mar 5 09:04:19 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | L | R | L | L | R | P | E | Q | V | L | K | R | L | A | V | C | V | D | T | A | I | L | E | D | A | G | A | D | V | L | M | E | A | L | E | A | L | G | C | E | C | R | I | E | P | Q | R | P | A | R | S | L | R | W | T | R | A | S | P | D | P | C | P | P | P | E | V | W | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | G | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | G | E | Q | E | L | L | L | L | L | E | P | E | E | F | L | Q | G | V | A | T | L | T | Q | W | I | S | P | E | T | T | A | R | P | H | L | A | V | I | G | L | D | A | Y | L | W | S | R | Q | H | A | V | S | W | P | E | V | E | E | A | L | V | L | L | Q | L | W | A | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | V | L | L | V | A | S | W | Q | E | L | S | R | H | V | C | A | V | T | K | A | L | A | Q | Y | P | L | K | Q | Y | R | E | S | Q | A | F | S | F | C | T | A | A | G | E | P | V | A | R | D | G | A | G | L | Q | A | A | W | R | R | Q | I | R | Q | F | S | R | V | S | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | B | T | T | B | S | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | A | D | A | V | V | T | A | F | P | S | P | R | L | L | Q | Q | A | L | E | A | C | S | T | E | R | E | R | M | G | L | L | A | D | L | P | V | P | P | S | E | G | G | R | P | R | R | V | G | P | D | L | S | R | R | I | C | L | F | L | T | T | A | N | P | D | L | L | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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