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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7e7mC_ | 2.85 | PDB header: sugar binding protein | Chain: C: PDB Molecule: d-ribose abc transporter substrate-binding protein; |
Added to library: Sat Mar 5 11:01:38 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | T | K | K | S | A | K | D | L | K | L | G | V | S | I | S | T | T | N | N | P | Y | F | V | A | M | K | D | G | I | D | K | Y | A | S | N | K | K | I | S | I | K | V | A | D | A | Q | D | D | A | A | R | Q | A | D | D | V | Q | N | F | I | S | Q | N | V | D | A | I | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | P | V | D | S | K | A | I | V | T | A | I | K | S | A | N | N | A | N | I | P | V | I | L | M | D | R | G | S | E | G | G | K | V | L | T | T | V | A | S | D | N | V | A | A | G | K | M | A | A | D | Y | A | V | K | K | L | G | K | K | A | K | A | F | E | L | S | G | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | A | S | A | T | V | D | R | G | K | G | F | H | S | V | A | K | S | K | L | D | M | L | S | S | Q | S | A | N | F | D | R | A | K | A | L | N | T | T | Q | N | M | I | Q | G | H | K | D | V | Q | I | I | F | A | Q | N | D | E | M | A | L | G | A | A | Q | A | V | K | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | L | Q | N | V | L | I | V | G | I | D | G | Q | P | D | A | H | D | A | I | K | K | G | D | I | S | A | T | I | A | Q | Q | P | A | K | M | G | E | I | A | I | Q | A | A | I | D | Y | Y | K | G | K | K | V | E | K | E | T | I | S | P | I | Y | L | V | T | K | D | N | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | S | T | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | Y | N | W | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
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