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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7chaI_ | 3.90 | PDB header: membrane protein | Chain: I: PDB Molecule: probable atp-binding component of abc transporter, |
Added to library: Sat May 22 10:52:20 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | Y | A | V | E | L | K | G | L | T | F | K | R | G | S | R | A | I | F | D | N | I | D | V | R | I | P | R | G | K | V | T | G | I | M | G | P | S | G | C | G | K | T | T | L | L | R | L | I | A | S | Q | L | R | P | S | K | G | E | V | W | V | N | G | Q | N | L | P | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | R | G | D | L | F | D | M | R | K | Q | F | G | V | L | F | Q | S | G | A | L | F | T | D | L | D | V | F | E | N | V | A | F | P | L | R | V | H | T | Q | L | P | E | E | M | I | R | D | I | V | L | M | K | L | Q | A | V | G | L | R | G | A | V | E | L | M | P | D | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | T | T | B | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | G | G | M | K | R | R | V | A | L | A | R | A | I | A | L | D | P | Q | I | L | L | Y | D | E | P | F | V | G | Q | D | P | I | A | M | G | V | L | V | R | L | I | R | L | L | N | D | A | L | G | I | T | S | I | V | V | S | H | D | L | A | E | T | A | S | I | A | D | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | ||
Sequence | Y | I | V | G | D | G | R | V | L | G | H | G | T | P | D | V | L | K | E | T | D | D | P | R | I | R | Q | F | V | K | G | I | P | D | G | P | V | P | F | H | Y | P | A | R | D | Y | R | A | D | L | L | G | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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