| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c7c98A_ | 3.47 | PDB header: recombination/dna | Chain: A: PDB Molecule: meiotic recombination protein dmc1/lim15 homolog; |
Added to library: Sat Nov 21 08:39:05 2020 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | Q | D | I | D | L | L | Q | K | H | G | I | N | V | A | D | I | K | K | L | K | S | V | G | I | C | T | I | K | G | I | Q | M | T | T | R | R | A | L | C | N | V | K | G | L | S | E | A | K | V | D | K | I | K | E | A | A | N | K | L | I | E | P | G | F | L | T | A | F | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | E | K | R | K | M | V | F | H | I | T | T | G | S | Q | E | F | D | K | L | L | G | G | G | I | E | S | M | A | I | T | E | A | F | G | E | F | R | T | G | K | T | Q | L | S | H | T | L | C | V | T | A | Q | L | P | G | A | G | G | Y | P | G | G | K | I | I | F | I | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | S | S | T | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | N | T | F | R | P | D | R | L | R | D | I | A | D | R | F | N | V | D | H | D | A | V | L | D | N | V | L | Y | A | R | A | Y | T | S | E | H | Q | M | E | L | L | D | Y | V | A | A | K | F | H | E | E | A | G | I | F | K | L | L | I | I | D | S | I | M | A | L | F | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | F | S | G | R | G | E | L | A | E | R | Q | Q | K | L | A | Q | M | L | S | R | L | Q | K | I | S | E | E | Y | N | V | A | V | F | V | T | N | Q | M | T | A | D | P | G | A | P | K | K | P | I | G | G | H | I | L | A | H | A | S | T | T | R | I | S | L | R | K | G | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | L | R | I | A | K | I | Y | D | S | P | E | M | P | E | N | E | A | T | F | A | I | T | A | G | G | I | G | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | S | S | B | S | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|