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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7c4jE_ | 2.89 | PDB header: dna binding protein | Chain: E: PDB Molecule: swi/snf global transcription activator complex subunit |
Added to library: Sat Jul 18 08:37:19 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | V | F | I | V | P | K | I | L | I | R | E | H | E | R | V | I | L | K | Q | I | L | Q | I | L | D | Q | D | E | L | V | Q | P | P | L | L | F | G | G | R | H | Y | L | F | N | T | F | T | A | H | M | G | V | L | L | V | L | L | Q | K | Y | I | T | A | R | S | A | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | F | G | A | S | V | I | A | G | G | Q | R | I | V | D | D | Y | W | E | Q | N | L | S | S | H | Q | R | V | F | K | L | S | T | N | L | I | S | K | I | S | L | L | R | P | S | F | P | I | V | T | E | Q | P | S | A | E | I | R | E | A | Y | I | E | N | F | A | K | G | E | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | S | A | I | V | P | G | Q | S | I | S | G | T | L | E | L | S | A | Q | F | R | V | P | R | Y | H | S | K | N | S | F | Q | Q | A | L | Q | M | K | A | Q | Y | Y | R | G | L | P | L | Y | E | K | N | T | L | L | E | R | L | K | Q | L | T | P | N | E | I | K | E | L | E | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | H | D | A | V | F | V | N | T | G | L | Q | N | V | R | K | V | R | T | K | K | W | K | K | Y | W | Q | Y | K | A | G | I | P | I | G | L | K | R | S | Q | L | D | E | F | K | N | K | Y | L | K | D | V | L | A | K | R | V | P | N | P | N | F | L | G | N | C | N | I | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | K | P | P | Y | I | Y | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
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