| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c7c4jC_ | 2.89 | PDB header: dna binding protein | Chain: C: PDB Molecule: transcription regulatory protein snf6; |
Added to library: Sat Jul 18 08:42:27 2020 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | Q | Q | Q | L | N | K | Q | R | Q | D | F | E | R | V | R | L | R | P | E | Q | L | S | N | I | I | H | D | E | S | D | T | I | S | F | R | S | N | L | L | K | N | F | I | S | S | N | D | A | F | N | M | L | S | L | T | T | V | P | C | D | R | I | E | K | S | R | L | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | K | T | I | R | Y | L | M | Q | K | Q | H | E | M | K | T | Q | K | P | L | T | P | L | K | Y | T | K | L | I | A | A | A | E | D | G | S | R | S | T | K | D | M | I | D | A | V | F | H | L | R | Y | Q | P | D | G | V | V | V | H | R | D | D | P | A | L | V | G | K | W | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | H | A | Y | R | D | V | L | A | Q | Y | H | E | A | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|