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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7abiP_ | 8.00 | PDB header: splicing | Chain: P: PDB Molecule: pre-mrna-splicing factor rbm22; |
Added to library: Sat Feb 13 09:35:33 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | W | E | D | A | D | F | P | I | L | C | Q | T | C | L | G | E | N | P | Y | I | R | M | T | K | E | K | Y | G | K | E | C | K | I | C | A | R | P | F | T | V | F | R | W | C | P | G | V | R | M | R | F | K | K | T | E | V | C | Q | T | C | S | K | L | K | N | V | C | Q | T | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | D | L | E | Y | G | L | P | I | Q | V | R | D | A | G | D | M | L | L | K | L | A | R | T | T | P | Y | Y | K | R | N | R | P | H | I | C | S | F | W | V | K | G | E | C | K | R | G | E | E | C | P | Y | R | H | E | K | P | T | D | P | D | D | P | L | A | D | Q | N | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | T | T | S | S | B | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | D | R | Y | Y | G | I | N | D | P | V | A | D | K | L | L | K | R | A | S | T | M | L | Y | V | G | G | L | G | D | T | I | T | E | T | D | L | R | N | H | F | Y | Q | F | G | E | I | R | T | I | T | V | V | Q | R | Q | Q | C | A | F | I | Q | F | A | T | R | Q | A | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | V | A | A | E | K | S | F | N | K | L | I | V | N | G | R | R | L | N | V | K | W | G | R | S | Q | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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